Постоянная экспозиция музея представляет историю СССР через призму политических репрессий и сопротивления общества советскому режиму. В Москве это первая открытая для широкой публики экспозиция, посвященная памяти миллионов людей, принесенных в жертву коммунистической утопии. Первый раздел экспозиции музея представляет парадный портрет социализма в СССР, оформленный в виде яркого красочного коллажа из фотографий, плакатов, строчек советских песен и лозунгов. Второй раздел экспозиции музея посвящен истории политических репрессий в СССР и охватывает период с 1917 г. до середины 1950-х годов. Третий раздел Путь через ГУЛАГ. Идея экспозиции подсказана книгой Александра Солженицына «Архипелаг ГУЛАГ». Она рассказывает о пути человека, попавшего в лагерь и прошедшего несколько кругов гулаговского ада: арест, следствие, приговор, лагерь, освобождение и реабилитация.